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从甲醛处理的组织样本中拯救遗传物质的方法

2019-09-02

每年,从癌症患者中收集数百万个组织样本并保存在甲醛中。该化学物质“冻结”样本中的癌细胞,使医生能够观察疾病并规划特定的治疗过程。
 
 
然而,该过程覆盖了组织内的遗传物质,使得难以应用可以揭示更好的个性化疗法的下一代遗传分析。现在,斯坦福大学的化学家和医生团队已经开发出一种技术,可以显着提高这些样本中遗传物质的回收率。
 
“病理学家过去只是在显微镜下观察组织,所以甲醛就在那里并不重要,”斯坦福大学化学教授,该研究的资深作者Eric Kool说。 “现在的趋势是根据他们的遗传情况对待人们,问题是,甲醛阻碍了这一点。我们已经找到了扭转这一过程的方法。”
 
科学家和医生都渴望了解组织样本中RNA的数量和序列 - 负责编码蛋白质的遗传物质 - 因为这些信息可以极大地改善疾病的诊断。这反过来可以告知最佳治疗途径,并导致更好和更准确的预后。例如,特定类型癌症的一种遗传变异可能对特定药物治疗反应良好,而另一种则对辐射更好。
 
当甲醛“固定”组织时,它与RNA紧密结合。然而,除去甲醛的最有效方法包括加热样品,这会产生不良影响。
 
“热量会比去除甲醛更快地破坏RNA,”库尔说。 “我们从样本中恢复得很少,很难读懂。”
 
Kool和他的同事专注于RNA和DNA化学,他们开发了可在温和温度下操作的催化剂分子,以选择性地破坏甲醛和RNA之间的键,使遗传物质自由且完好无损。 Kool说,这种方法可以用来处理任何组织样本。
 
从样品中拯救DNA和蛋白质,甲醛也面临同样的挑战,因此Kool和他的同事们正在研究类似的基于催化剂的方法是否也可以提高这些分子的回收率。
 
该研究发表于Nature Chemistry,由Ash Alizadeh,Luzi Barandun,Thomas Ehrenschwender,Emily Harcourt,David Hewings,Saswata Karmakar,David Kurtz,Alexander Lovejoy和Caroline Roost共同撰写。一家名为Cell Data Sciences的公司成立,旨在开发和商业化该技术。

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